Chytridiomycota, nombre que significa "olla pequeña" debido a la forma de la estructura que contiene las zoosporas no liberadas en algunas especies, es un linaje de hongos de distribución mundial, que habita tanto en el agua como en la tierra y frecuentemente dentro de otros organismos.

Son hongos primitivos, generalmente microscópicos, con paredes celulares de quitina, nutrición por absorción, uso de glucógeno como molécula de almacenamiento de energía y con esporas nadadoras gracias a un flagelo. Son organismos descomponedores o parásitos de animales y plantas, que pueden formar o no pequeños micelios, sin tabiques entre las distintas células. En el caso de las especies parásitas este micelio se forma dentro del huésped. La reproducción puede realizarse por la formación de un único esporangio por micelio, de gran tamaño comparado con el tamaño del micelio, o de varios esporangios que son entonces relativamente pequeños. Sus esporas se caracterizan por tener un flagelo que les permite nadar, contienen una gota lipídica, un casquete nuclear compuesto básicamente por ribosomas y con doble membrana y por un orgánulo peculiar llamado rumposoma cuya función no está clara pero se utiliza como característica taxonómica. La reproducción sexual puede tener lugar por la fusión de dos esporas móviles a modo de espermatozoide, o por la fusión de una espora móvil e una inmóvil a modo de óvulo. Además puede tener lugar por fusión de dos células vegetativas de micelios independientes, que intercambian núcleos. Tras la fecundación, la célula zigótica suele formar una espora de reposo que permite sobrevivir a periodos desfavorables.

El filo Chytridiomycota tiene una posición intermedia entre los linajes más primitivos de hongos y los mohos y hongos con setas. Una característica de su naturaleza primitiva son sus esporas nadadoras con flagelos, que se han perdido en los hongos superiores.